建设全国碳市场是利用市场机制控制和减少温室气体排放、推进绿色低碳发展的一项重大制度创新，也是推动实现碳达峰目标与碳中和愿景的重要政策工具。自2013 年至2020年期间，全国在北京、上海、天津、重庆、湖北、广东、深圳、福建等八省市开展了碳排放权交易试点工作。经过多年的努力和探索，全国碳排放权交易市场于2021年7月16日正式上线，第一个履约周期为今年全年，首先纳入发电行业重点排放单位2162家，覆盖约45亿吨二氧化碳排放量，是全球规模最大的碳市场。
3E研究所长期以来全面深入参与中国地方和全国的碳市场建设，在理论构建、政策制定、培训等各个环节均发挥了重要作用。其中在这一领域的部分主要研究工作包括有：《我国碳排放权交易体系的评估与完善研究》、《中国碳市场覆盖范围、总量设定、配额分配方法和抵消机制研究》、《中国碳市场管理办法、管理机制和监管体系研究》、《碳税与碳关税对北京市经济发展的影响与对策》、《北京市碳排放权交易试点建设研究》、《国家碳交易登记系统灾难备份恢复项目》、《全国碳排放权交易体系中配额分配方法的评估并改进》和《全球碳市场研究》等等。